该组织的最新周年报告名为“公元二千年新闻界所受攻击”，长达五百五十页，当中列举了全球超过六百个新闻自由遭挑战的个案，其中有两页是描述香港新闻界情况。
报告详述三宗曾轰动香港新闻界的事件，当中包括去年三月有线电视在台湾举行总统选举后，播出当选副总统的吕秀莲的访问，指台湾与中国大陆是“远亲”后，即时惹来中联办副主任猛烈抨击，并“教导”香港新闻界不能报导有关台湾独立与西藏独立的消息，其后记协收到八百多名记者签名，誓言不做宣传机器。
报告指很多观察家认为事件已逐步削弱了他们在江泽民的“一国两制”下对香港新闻自由的信心，认为是“鼓励”香港记者在处理大陆新闻时自我审查。
报告接着列举去年十月，大陆国家主席江泽民在北京接见往述职的特首董建华时，被问及是否已钦点董作为第二届特首时，当着电视镜头，怒斥香港记者“Too imple, Sometimes naive”(太简单，有时更是太幼稚)。多份报章都认为江泽民是自坏声誉，报告指此举正显示中、港两地政治文化的差异。
最后，报告指前《南华早报》中国版编辑林和立，因报导触怒老板而被迫辞职，此举被很多人视为江泽民不满香港传媒的征兆。
中文大学亚太研究所副所长刘兆佳表示，部分传媒因经济及政治等种种原因而自我约束，实属无可厚非，因为不能期望每个人都勇往直前。
他又说江泽民正因为不满意香港传媒才发怒，显示香港传媒敢于批评。
但浸会大学新闻系助理教授杜耀明认为，中联办副主任及江泽民事件显示，当江泽民对香港传媒超越容忍极限时，往往表现很奇异的态度。他认为不应对北京存在不必要的幻想，强调新闻自由是要争取得来的。
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