军方隐瞒疫情是造成北京疫情扩散的原因，「华盛顿邮报」引述消息人士表示，温家宝在巡视疾病控制预防中心时，批评军方隐瞒疫情，并且强调要告诉人民实情。日前一名退休的北京外科医生蒋彦勇曾写一封公开信指责三○一医院隐瞒疫情，另一名中共疾病控制预防中心的官员也批评，如果不是军方医院一开始隐瞒疫情，北京目前的SARS疫情也不会这么严重。
此外，数星期前当SARS疫情在北京猖獗时，北京市领导也对中央隐瞒实际疫情，一名西方大使指出，这就好像华盛顿的疫情已相当严重，但白宫却浑然不知。世界卫生组织（ＷＨＯ）在北京办公室发言人也说，中共中央的确不知道疫情。
其实，中南海里的中共高层领导里有许多「北京帮」，例如前北京市书记贾庆林，他是现任中共九名政治局常委之一，另外，现任北京市书记刘淇为中共政治局委员之一，他们会向胡、温两人隐瞒疫情并不奇怪。
前中共卫生部长张文康也是了解北京市实情的其中一人，三月廿七日北京一名病毒学家毕山林（音）曾警告张文康办公室里的一名高层官员，「ＳＡＲＳ将为北京带来灾难，我们必须想想办法。」
但是这名官员告诉他，部里已经知道这件事。毕山林又强调，他们得先和政府其他部门协调。最后北京告诉中央，「没有问题」，「我们可以处理，小事一桩」，毕山林指出，隔天一堆医护人员都感染了SARS。
一名卫生部官员说，北京不如其它省市尊重中央，在很多问题上似乎毫不在意。邓小平死后没几年，江泽民就将其亲信贾庆林调任北京，最终形成了眼下亲江的「北京帮」。
不久之后，胡锦涛以中共中央军委副主席的身份，要求军方医院公布实际的感染人数，四月廿日中共卫生部副部长高强公布初步的统计数字，人数大幅攀升，隔天张文康随即丢官，但胡锦涛的人前北京市长孟学农也跟着下台。
不过，大陆消息人士表示，胡锦涛和温家宝对军方的压力迫使他们不得不直接面对江泽民，至今江泽民对于疫情仍未做出任何回应，江泽民只是在上海与印度国防部长费南德斯会面时指出，中共控制疫情方面取得了明显成效。