《中国》电子期刊的主办人时寒冰就此发表文章:
《南方周末》2002年3月21日有2个不同的版本！原因是《南方周末》披露了有关希望工程的丑闻，最终遭到查封。伸向希望工程的黑手不仅仅毁坏了中国希望工程的声誉，也毁坏了中国“有关部门”的信誉。我自己认为，这种腐败是天底下最为可耻的恶行之一，因为，它耽误的是渴望求学的孩子们的前途，它玷污的是一块最为神圣的事业。当那些畜生把贪婪的手伸向孩子们的时候，他们已经丧失了仅有的人性和良知。而且，希望工程的资金都来自于好心人的无偿赞助，正是那些钱在给孩子们带来微弱的阳光和希望，当他们知道自己的钱并没有给孩子们带来福音，而是被腐败分子吞噬的时候，他们的内心该是一种怎样的失望和哀痛……
然而，就是这样的禽兽不如的东西竟然也受到保护！
然而，就是这些的禽兽不如的恶行竟然也被无端掩盖！
我实在难以理解“有关部门”的行为。中国希望工程的黑幕曾经多次被国内外媒体披露，其声誉早已受到损害。如果“有关部门”当机立断，把腐败分子绳子以法，使资金的运作更加透明和公开，不仅仅希望工程的声誉会得到恢复，中国的声誉也会大大提高。
“有关部门”，你为什么总是以婊子的标准和婊子的手段作践自己！
“有关部门”，你现在在代表谁的利益！你是谁的部谁的门！
“有关部门”，当你与恶人狼狈为奸的时候你的合法性何在！
《南方周末》几经整肃，已经快死掉了。其实死掉的何止是一家报社，死掉的还有那些在极力捍卫自己最后信仰的人。当这些人被整肃以后，当这些人像其他人一样，对光身子的皇帝高唱赞歌的时候，恐怕死掉的就不是一两个人了，而是整整一个时代。
带著对人类尚未完全泯灭的良知的信任，在还没有堕落到去学唱赞歌之前，写下了上面的话。
《南方周末》那篇被枪毙的是作者方进玉的文章--《中国青基会"办公经费"隐瞒了什么？》，全文如下：
2月28日的中国青基会《严正声明》指出："中国青基会在实施希望工程的过程中，既不能在捐款中列支行政管理经费，也没有得到政府的一分钱经费拨款"，但"希望工程创造了世界公益事业发展史上低成本高效率运行的奇迹"。
然而，举报人指出：徐永光四处哭诉"希望工程办公经费严重不足"，不对。因为徐永光隐瞒了如下重要事实：
其一，因我国汇率调整，希望工程的外币捐款曾创造出不少"溢价收入"。希望工程接受的捐款分两部分，一是定向捐款，例如"结对"捐赠给失学儿童或指定捐赠的希望小学；另一部分是没有具体指向的，俗称"一般性捐款"。第二类捐款往往被老徐列入"希望工程基金"。而"一般性捐款"之中，又有许多是海外热心人士或海外社会团体、外资企业捐赠的外币捐款。到1997年7月，海外捐款占整个总捐赠的1/3强。而在1993年和1994年，据《希望工程调查报告》披露，海外捐款一度这到总捐款的1/2。
众所周知，1994年，我国政府曾调整外汇汇率，l美元从原来兑换人民币5元多"涨"到了8元多。汇率变化，使滞留在希望工程账上的外币捐款"增值"不少。国家规定，外币捐款利息以及因汇率调整而产生的"溢价收入"，均可"用作"希望工程的"办公经费"。这一数额较大的"收入"，同样可以支撑希望工程的"运转"，中国青基会无权对其忽略不计或者故意隐瞒。
问题是，青基会隐瞒过外币捐款的"利息收入"吗？答案，似乎是肯定的。
证据一，1993年2月25日，中国青基会与北京大兴财政局签订了《美元与人民币相互存款协议》，协议规定，中国青基会将美元200万元存入大兴财政局账户，大兴财政局则将1460万元人民币存入青基会账户，存款期限为三年，相互不"索取"利息，也不再"计较"利息差。此后几年，大兴财政局又存入青基会账户人民币110万元，美元4.8万元。证据进一步显示：三年存款期满之后的1996年8月，中国青基会才发现，按照当时美元汇率8.3071计算，大兴财政局仍"欠"青基会51.5万元。徐永光立即发出指示："基金部应尽快将大兴财政局欠款追回，争取在年内把账调整过来，以减少审计风险"。
证据二，1995年6月28日，中国青基会致函深圳新产业公司，称：请按我会与贵公司199 5年3月31日签署的协议书第二款规定，将我会存留在你账户上的10万美元（原有50万，现存10万），电汇49000美元于我会指定账户。开户名：北京仁美广告有限公司。开户行：中行北京分行国贸中心分理处。账号：148250036068。
记者查实：此次调度外汇的原因是，中国青基会领导、省级青基会秘书长以及受助大学生，需组团赴北欧"考察"，且事先由"北京恒美"代为垫支49000美元，汇至芬兰航空公司作为出国费用。因此，中国青基会需从"深圳新产业"调出同样数额美元，归还"北京恒美"。
证据还显示，至1997年9月，中国青基会在深圳新产业的"存款利息"已有63万余元（系5 0万美元、10万美元和5.1万美元分段计算的人民币利息）。此时，青基会领导要求下属完成的"任务"是：1．"请基金部协助催收51000美元的欠款"；2．将63万元利息调回我会账户，以便"尽早将该笔账做平"。
国家有关部门对希望工程一直予以照顾，允许青基会在中国银行开设"现汇账户"。其好处是，外币捐款到账后，不必像一般外贸企业赚取外汇那样被立即兑换为人民币存款，而是可以无限期地以外币形式存放在银行，并可根据需要或者汇率变化，随时兑换。可是，青基会领导人仍嫌这一"照顾"不够宽松，于是把200万美元存入了北京大兴财政局，把50万美元"存"在了深圳新产业公司。
其二，"希望工程纪念币"也曾给希望工程带来"超值收入"。
1994年10月26日，为纪念希望工程实施5周年，中国人民银行发行了"希望工程纪念币"，该币面值1元，但因其发行量不大，且邓小平手书的"希望工程"4个字和英文的"中国人民银行"几个字被同时镌刻在硬币上，因此在钱币收藏市场上，希望工程纪念币后来可以卖出较高价格。
负责纪念币"运作"的中国青基会基金部刘文华，在《希望工程调查报告》一书中对此做了陈述：希望工程纪念币发行2000万枚，经我们努力，中国人民银行直接"批给"了我们1000万枚，让我们在希望工程实施系统内发行，这是空前的，可能也是绝后的。我们把500万枚兑换给各省青基会（记者调查发现：并未全部按原价1元兑换给各省），另500万枚用于装帧为纪念品，现在（1997年）一枚纪念币的市场价格达到30元……刘文华说：如果"控制得再严些，收入可这2个亿，甚至会更多"。
记者曾向希望工程原财务人员追问：兑换外币捐款所产生的"溢价收入"，以及"运作纪念币"的超值收入，合计到底有多少？这些财务人员的回答，模糊而又不尽相同，有人说，"仅外币溢价兑换一项，就大大帮了老徐一把"；有人说，"1000万枚纪念币，按每枚平均获利5元计算，就有5000万元的溢价收入，这是最保守估计"；还有人说："结对"救助小学四五年级学生，因为救助对象不到五年就毕业了，因此捐款有结余，数额也很巨大；又有人说：发起并组织希望工程义演、义赛，收入也不少……
记者惊问：你们都曾在财务部工作，怎么会说不清呢？
他们回答：对不起，上述运作并未全部纳入青基会的财务管理。
说不清的，暂且搁置。让我们找一点能够"说清楚"的来说说。
徐永光曾在2001年对某报记者说："11年来，中国青基会的工作经费总支出是8800万元"（注：年均800万）；"利用每年平均大约5600万的待拔捐款的增值"，11年来，青基会总计获得了7000多万元的收入；但相互折抵，到2001年3月"中国青基会已经有1700万元的赤字"。
不过，几位青基会的财务人员指出：按保守估计，中国青基会外币兑换溢价、纪念币运作、足球义赛、文艺义演等等，其总收入应该超过6000万元，足以填补1700万元的工作经费"窟窿"。
还有，记者请柳杨帮助算了一笔账，如果徐永光能够遵纪守法"不去投资"，而是把希望工程的"待拨款"全部存在银行里，按照1989年至2000年逐年银行利息，以1年期存款和3年期存款计算，青基会也可分别获得5205万元（1年期）或者5804万元（3年期）的稳定收益。